| 2012 |
中國環境治理：統合協力治理觀點-總計畫暨子計畫二：「水政治」─中國西南地區的水域開發與環境治理 |
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| 2011.01 |
中國環境治理：統合協力治理觀點：第一子計畫：「水政治」─中國西南地區的水域開發與環境治理 |
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| 2011 |
2010世界價值觀調查─台灣 |
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| 2011 |
民族主義的民主神學：中國與台灣(III) |
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| 2011 |
中國環境治理：統合協力治理觀點-子計畫一：中國環境治理的「同享權利」：理論與制度 |
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| 2010 |
民族主義的民主神學---中國與台灣(II) |
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| 2009 |
赴歐洲考察歐盟政治整合以及其政治學研究與教育的最新發展 |
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| 2009 |
民族主義的民主神學---中國與台灣(I) |
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| 2009 |
補助人文及社會科學研究圖書計畫規劃主題---近二十年的宗教理論與方法 |
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| 2008 |
台灣政治學期刊評比 |
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| 2008 |
華人社會之基督教與民主---台灣、香港、新加坡 |
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| 2008 |
台灣地區宗教經驗之比較研究 |
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| 2007 |
華人社會之基督教與民主---台灣、香港、新加坡 |
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| 2006 |
亞洲多元宗教市場中的基督教與民主：台灣與南韓的比較 |
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| 2006 |
補助人文及社會科學研究圖書計畫規劃主題---宗教文化史(亞洲宗教的現代化與後現代化) |
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| 2004 |
宗教容忍：政治哲學與神學的對話 |
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| 2003 |
台灣網際網路產業發展的政治經濟分析--後續研究計畫 |
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| 2003 |
台灣民主化的宗教基礎（II） |
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| 2002 |
基督教的宗教容忍 |
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| 2001 |
台灣網際網路產業發展的政治經濟分析 |
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| 2001 |
台灣民主化的宗教基礎(I) |
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| 2000 |
基督教與民主政治之制度連結 |
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| 1999 |
比較台灣與東亞國家的制度調適(2/3) |
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| 1999 |
政教關係的理論與實踐 |
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| 1997 |
東亞民主化與經濟發展---政治經濟策略結構理論 |
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